本市第一、二果菜批發市場為市府委託臺北農產運銷公司經營管理，其維繫著本市蔬果供應穩定及進場蔬果檢驗把關之任務，有鑑於檢驗技術進步與資訊化時代來臨，市府自108年9月21日起即輔導臺北農產公司導入質譜化學快檢技術，成為全台首間使用此技術把關進場蔬果之批發市場，與過去化學法檢驗方式相比，可在當日拍賣前之有限時間內達到快速檢驗之成效與精準度，另搭配109年建立之供應人實名制系統，檢驗不合格蔬果在交易前能迅比對供應代號及身分資料，並依規定禁止交易及銷毀。
每年3月為平地高麗菜盛收期，近期漸進入夏季，主要盛產品項包含蕹菜、甘薯葉、菜豆、茄子等菜種，臺北農產公司除向產地供應單位宣導做好病蟲害防治及自主農藥檢測，針對國內季節性供應果菜亦會進行加強抽驗，為市民健康把關。市府鼓勵民眾可多選購當令蔬菜，買回家後搭配流動水與軟毛刷清洗，安心補足每日膳食纖維及維生素。112年3月共計抽驗1,448件蔬果產品，檢驗結果123件不符合規定，銷毀重量計52,266公斤，不合格率8.49%，其中主要品項為辣椒、油菜及青江白菜，經臺北農產公司追查產品來源，供應人主要來自雲林縣、屏東縣及嘉義縣，後續已依程序函報農糧署、該供應人所屬地方政府農政機關，以溯源農民農藥管理。
